- e Registre d'inquisition de Jacques Fournier, évêque de Pamiers, 1318-1325 : manuscrit Vat. latin no 4030 de la Bibliothèque vaticane, publié avec introduction et notes par Jean Duvernoy (3 volumes, 1965). Réédition : Tchou, Paris, 2004.
- Inquisition à Pamiers, interrogatoires de Jacques Fournier : 1318-1325, choisis, traduits du latin et présentés par Jean Duvernoy, 1966
- Chronique, [1203-1275], par Guillaume de Puylaurens, texte édité, traduit et annoté par Jean Duvernoy, 1976
- La religion des cathares, 1976 [1] [archive]
- L'histoire des cathares, 1979
- Inquisition à Pamiers : cathares, juifs, lépreux, devant leurs juges, 1986
- Spirituels et béguins du Midi, par Raoul Manselli, traduction de Jean Duvernoy, 1989
- Cathares, vaudois et béguins : dissidents du pays d'Oc, 1994
- Chronique, 1229-1244 par Guillaume Pelhisson, texte édité, traduit et annoté par Jean Duvernoy, 1994
- Le Dossier de Montségur, interrogatoires d'inquisition, 1242-1247 traduit, annoté et présenté par Jean Duvernoy, 1998
- Les cathares, Jean Duvernoy, 1998
- Le procès de Bernard Délicieux, 1319, traduit, annoté et présenté par Jean Duvernoy, 2001
- L'Inquisition en Quercy : le registre des pénitences de Pierre Cellan, 1241-1242, préfacé, traduit du latin et annoté par Jean Duvernoy, 2001
- Martin Aurell (sous la dir. de) ; Anne Brenon et Christine Dieulafait (textes rassemblés par), Les Cathares devant l'histoire : mélanges offerts à Jean Duvernoy, l'Hydre, coll. « Domaine historique », Cahors, impr. 2005, 24 cm, 457 p. (ISBN 2-913703-57-7) Mélanges réalisés à partir des actes des journées de rencontres organisées aux Archives départementales, Foix, 12-
